Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms