Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OTX2P32243 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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OTX2P32243 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OTX2P32243 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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