Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms