Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD40LGP29965 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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