Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB2P29033 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB2P29033 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GJB2P29033 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJB2P29033 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms