Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRMP28827 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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