Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD10P28358 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms