Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms