Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms