Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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