Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PTPRDP23468 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PTPRDP23468 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRDP23468 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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