Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB9P17482 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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