Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPCAMP16422 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms