Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB1P16220 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms