Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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