Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RALAP11233 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RALAP11233 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RALAP11233 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RALAP11233 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RALAP11233 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RALAP11233 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RALAP11233 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RALAP11233 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms