Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNB1P11230 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms