Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC192P0DO97 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms