Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PGA3P0DJD8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms