Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C4BP0C0L5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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