Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACAA1P09110 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms