Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC4P09017 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC4P09017 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC4P09017 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC4P09017 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms