Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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