Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EGFRP00533 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGFRP00533 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms