Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PLIN3O60664 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms