Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR5O60602 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR5O60602 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms