Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KDELR3O43731 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms