Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms