Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms