Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PATL2C9JE40 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms