Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms