Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms