Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54L2Q9Y4B4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms