Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FBXL4Q9UKA2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FBXL4Q9UKA2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms