Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STAG3Q9UJ98 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms