Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms