Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms