Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms