Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms