Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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