Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MMP26Q9NRE1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms