Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLXNA4Q9HCM2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PLXNA4Q9HCM2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms