Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BARX1Q9HBU1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms