Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NRDE2Q9H7Z3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms