Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLMPQ9H6B4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms