Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM54Q9BYV2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms