Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms