Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms