Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PMCHL2Q9BQD1 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMCHL2Q9BQD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms