Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIN3AQ96ST3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms